Родоначальник Кубанского БВУ - Азово-Черноморская бассейновая инспекция по регулированию использования и охране водных ресурсов на территориях Ставропольского и Красно-царского краев, с входящими тогда в их состав Сарачаево-Черкесской и Адыгейской АО, была создана приказом Госкомвода РСФСР от 02.06.1962 г. № 264 во исполнение Постановления Совмина СССР от 22.04.1960 г. № 425 «О мерах по упорядочению использования и усилению охраны водных ресурсов СССР».

На инспекцию были возложены задачи: организации рационального использования и учета количества потребляемой воды из поверхностных и подземных источников; изучения состояния дел у водопользователей с использованием воды и степенью очистки сточных вод; паспортизации всех водозаборов и сбросов в водные объекты; осуществлением госнадзора за проведением мероприятий по рациональному использованию родных ресурсов, а также по борьбе с их истощением и вред-!ным воздействием; охрана поверхностных и подземных водных источников, а также прибрежных полос рек, лиманов, озер и морей от загрязнения и засорения. 

Для осуществления контроля за качественным составом сбросных вод, эффективностью работы очистных сооружений и обезвреживающих устройств была создана гидрохимическая лаборатория. С 1965 г. в структуре Управления начали образовываться линейные участки: Черноморский I и II с дислокацией в городах Туапсе и Новороссийск, Ставропольский I и II в городах Невинномысск и Пятигорск. В 1969 г. — Краснодарский (г. Краснодар), Азовский (г. Ейск) и краевой Ставропольский (г. Ставрополь) участок.

В октябре 1974 г., на основании приказа Минводхоза РСФСР, инспекция была реорганизована в Азово-Черноморское бассейновое управление по регулированию использования I и охране вод (АЧБУ). Вместо Производственного отдела были созданы отдел охраны и отдел регулирования использования вод, линейные участки были реорганизованы в гидрохимлаборатории с созданием в них аналитических отделов.

Программным документом в работе АЧБУ стало Постановление ЦК КПСС и Совмина СССР от 16 января 1976 г. № 42 «О мерах по предотвращению загрязнения бассейнов Черного и Азовского морей». Значительно возросли объемы средств выделяемых на строительство систем оборотного водоснабжения, комплексов очистных сооружений и сетей канализации, глубоководных выпусков. Если в 1963 г. на водоохранное строительство было отправленно 2,5 млн. руб., то в 1979г. - 48 млн. руб.в год. С 1976 по 1980г. включительно было выделено и освоено 141 млн. руб., построены крупнейшие комплексы очистных сооружений и сетей канализации в гг. Краснодаре, Ставрополе, Невинномысске, Армавире, Черкесске, Новороссийске, Туапсе, Сочи, объединенные очистные сооружения Кисловодска, Ессентуков, Пятигорска. Строительство очистных сооружений велось практически во всех районных центрах.

После упразднения Минводхоза СССР на баланс БВУ было передано крупнейшее на Северном Кавказе Краснодарское водохранилище.

Происходящее в стране с ,1991 г. изменение политической и экономической ситуации не могло не отразиться на состоянии всего водохозяйственного комлекса.

После административной реформы 2004 г. Кубанское БВУ является территориальным органом Росводресурсов межрегионального уровня, выполняет функции по оказанию госуслуг и управлению федеральным имуществом в сфере водных ресурсов в пределах бассейна р. Кубань и др. водных объектов на территории Краснодарского края, Карачаево-Черкесской Республики, Ставропольского края, Республики Адыгея, где расположены  являющиеся структурными подразделениям Управления отделы водных ре сурсов, и в пределах своих пол номочий осуществляет: терри ториальное перераспределен» стока поверхностных вод; уста новление режимов пропуска па водков, наполнения и сработю водохранилищ; осуществление мер по предотвращению негативного воздействия вод и ликвидации его последствии в отношении водных объектов, расположенных на территориях двух и более субъектов РФ; предоставление в пользование водных ресурсов и акваторий Егорлыкского, Краснодарского, Кубанского (большого), Курского, Новотроицкого, Сенгилеевского, Шапсугского водохрани лищ, а также Черного и Азовс кого морей в пределах Красно дарского края; администрирова ние платы за пользование вод ными объектами по договора заключенным БВУ; утверждение нормативов допустимо сброса веществ и микроорганизмов в водные объекты; разработку и реализацию схем комплексного использования и охраны водных объектов, правил использования водных ресурсов и технической эксплуатации водохранилищ; ведение Государственного водного реестра включая госрегистрацию договоров водопользования и решений о предоставлении в пользование водных объектов и Российского регистра ГТС.

При БВУ работают Межведомственная оперативная группа, Научно-технический и Бассейновый советы. Важное значение в деятельности БВУ занимает осуществление госмониторинга водных объектов, расположенных в зоне строительств; Олимпийских объектов на территории г. Сочи.

Источник:"Природно ресурсные ведомости"