В конце прошлого столетия в водном секторе Азербайджана произошли реорганизации. В 1993 г. Министерство Мелиорации и Водного Хлзяйства Азербайджана переименовано в Комитет Мелиорации и Водного Хозяйства при Кабинете Министров Азербайджанской Республики. В 2004 г. на его базе создано Государственное Агентство Мелиорации и Водного Хозяйства при Министерстве Сельского Хозяйства Азербайджанской Республики, а в 2006 г. на базе этого Агентства было создано Открытое Акционерное Общество Мелиорации и Водного Хозяйства Азербайджана.

Основные функции Акционерного Общества: обеспечить отрасли экономики республики водой и осуществить контроль за рациональным использованием водных ресурсов; обеспечить отвод с помощью коллекторно-дренажных систем минерализованные воды с мелиорированных земель; осуществить эксплуатацию находивщихся на балансе Акционерного Общества водохозяйственных и мелиоративных объектов; проводить противоселевые мероприятия; осуществлять функции заказчика по объектам капитального строительства и проектирования, финансируемых за счет бюджета; обеспечить развитие отрасли на основе современной науки, техники и прогрессивных технологий.
В настоящее время в Азербайджане функционирует сложная водохозяйственная система: широкая сеть оросительных, дренажных каналов, насосных станций, перераспределяющих сток, система регулирующих водохранилищ.
  Эксплуатируются 135 водохранилища общей емкостью 21,5 млрд. м?, 51755 км оросительных каналов, 29640 км коллекторно-дренажных сетей, 118 тыс. шт. различных гидротехнических сооружений , 931 насосных станций, около 7,5 тыс. шт.субартезианских скважин, 1700 км защитных дамб от селей и наводнений и другие водохозяйственные и вспомогательные объекты.
В составе Акционерного Общества имеются 129 управлений и организаций. Также функционируют 3 ремонтно-механических завода и 1 завод железобетонных изделий, которые осуществляют ремонт плавучих станций, насосов разных марок, электродвигателей, трансформаторов и запасных частей к ним, изготавливают различные металлоконструкции для строительства и ремонта.
Акционерное Общество имеет один проектный и два научно- исследовательских института, в которых трудятся 13 докторов наук и более 80 кандидатов наук.
Дирекция строящихся мелиоративных и ирригационных объектов выполняет функции заказчика водохозяйственных объектов.

Открытое Акционерное Общество Мелиорации и Водного Хозяйства Азербайджана с 1997 г. представляет страну во Всемирном Водном Совете, с 2002 г. в Глобальном Водном Партнерстве, с 2006 г. в Международной Комиссии по Ирригации и Дренажу. Он длительный период тесно сотрудничает с Всемирным Банком, Азиатским Банком Развития, Саудовским Фондом Развития, ОПЕК и другими международными финансовыми организациями.
Азербайджан определился с проведением реформ в водном хозяйстве и установил, что объекты государственного назначения (водохранилища, межрайонные и межхозяйственные оросительные каналы, коллекторы, крупные насосные станции, гидроузлы, обводнительные системы, защитные дамбы вдоль рек Кура и Араз, режимно-наблюдательные скважины и др.) приватизации не подлежат. 
Для закрепления реформ в Азербайджане приняты законы «О мелиорации и ирригации» (1996г.), Водный кодекс (1997г.), «О водоснабжении и водоотведения» (1999г.), «О гидрометеорологической деятельности» (1998г.), «Об охране окружающей среды» (1999г.), «Об экологической безопасности» (1999г), (1999г.), «О водном хозяйстве муниципалитета» (2001г.), «О безопасности гидротехнических сооружений» (2003г.), а также Закон Азербайджанской Республики об изменениях и дополнениях (2004г.) в законе «О мелиорации и ирригации».
С 1996 года в стране начали создаваться АВП, сначала при поддержке Всемирного Банка, а к настоящему времени самими водопользователями создано 585 ассоциаций водопользователей, охватывающих около 760 тыс.гектар орошаемых территорий. Проектом Всемирного Банка «Ирригация,2» предусматривается передача в долговременное пользование и управление внутрихозяйственных оросительных и коллекторно-дренажных систем ассоциациям водопользователей как некоммерческим организациям. 
Согласно закону Азербайджанской Республики об изменениях и дополнениях (2004г.) в законе «О мелиорации и ирригации» предусматривается укрепление юридических основ АВП и переименование (в настоящее время 475 АВП перерегистрировались как ОВП) их в Объединения водопользователей (ОВП). В ОАО Мелиорации и Водного Хозяйства и на местах созданы соответственно Центральная и районные группы поддержки ОВП. 
С 1997 года в Азербайджане введено поэтапное платное водопользование и создан институциональный механизм и определены условия участия водопользователей при распределении лимитов оросительной воды.

 Азербайджан – край древнего орошаемого земледелия. В глубь веков уходит история его развития. Археологические исследования показывают, что система орошения в Азербайджане была аналогична древнейшим водным системам Египта, Индии и Китая. В Мильской степи сохранились следы крупного оросительного канала, сооружение которого относится к 1У – У1 векам. Следы древней ирригации встречаются в большом количестве и на Мугани, где до наших дней отчетливо сохранились трассы многих оросительных каналов.
 В настоящее время в республике имеется около 1 млн.450 тыс гектаров орошаемых земель, 90% валовой продукции сельского хозяйства приходится на долю орошаемых земель.


Главным подрядчиком мелиоративных и водохозяйственных строек является Государственная Акционерное общество «Азводстрой», действующее на контрактной основе с Комитетом мелиорации и водного хозяйства. До распада Советского Союза «Азводстрой» осваивал ежегодно по проектам «Азгипроводхоза» порядка 300 млн.долларов, имел мощную производственную базу, технику и оборудование.
Основной задачей является осуществление водохозяйственных мероприятий для повышения продуктивности существующих орошаемых земель и увеличения производства сельскохозяйственных продуктов.
 В настоящее время из имеющихся в республике орошаемых земель на площади около 610 тыс.га построена дренажная система, из них 326 тыс.га с закрытой сетью и на площади 13 тыс.га – вертикальные дрены.
Эксплуатируются 135 водохранилища общей емкостью 21,5 млрд. м?, 51755 км оросительных каналов, 29640 км коллекторно-дренажных сетей, 118 тыс. шт. различных гидротехнических сооружений , 931 насосных станций, около 7,5 тыс. шт.субартезианских скважин, 1700 км защитных дамб от селей и наводнений и другие водохозяйственные и вспомогательные объекты. 
Открытое Акционерное Общество Мелиорации и Водного Хозяйства Азербайджана является основным органом, ответственным за управление, использование и охрану водных ресурсов, эксплуатацию оросительно-дренажных систем, а также за проведение противоселевых и паводковых мероприятий. Управление Государственного Контроля по использованию и охране вод, подчинённое ГАМВХ проводит контроль над использованием и охраны водных ресурсов, а Управление гидрогеолого-мелиоративной службы проводит мониторинг по режиму грунтовых вод на орошаемых землях.
Азербайджан определился с проведением реформ в водном хозяйстве и установил, что объекты государственного назначения (водохранилища, межрайонные и межхозяйственные оросительные каналы, коллекторы, крупные насосные станции, гидроузлы, обводнительные системы, защитные дамбы вдоль рек Кура и Араз, режимно-наблюдательные скважины и др.) приватизации не подлежат. 
Для закрепления реформ в Азербайджане приняты законы «О мелиорации и ирригации» (1996г.), Водный кодекс (1997г.), «О водоснабжении и водоотведения» (1999г.), «О гидрометеорологической деятельности» (1998г.), «Об охране окружающей среды» (1999г.), «Об экологической безопасности» (1999г), (1999г.), «О водном хозяйстве муниципалитета» (2001г.), «О безопасности гидротехнических сооружений» (2003г.), а также Закон Азербайджанской Республики об изменениях и дополнениях (2004г.) в законе «О мелиорации и ирригации».
Кроме того, указом Президента Азербайджанкой Республики утверждены Государственные Программы «По экологически устойчивому социально-экономическому развитию страны», «По восстановлению и развитию лесов». «О рациональном использовании летних и зимних пастбищ, пашен и предотвращению опустынивания», «По развитию гидрометеорологии» и другие программы в Азербайджанской Республике.
С 1997 года в Азербайджане введено поэтапное платное водопользование и создан институциональный механизм и определены условия участия водопользователей при распределении лимитов оросительной воды. 
С 1996 года в стране начали создаваться АВП, сначала при поддержке Всемирного Банка, а к настоящему времени самими водопользователями создано 580 ассоциаций водопользователей, охватывающих 60% орошаемых территорий. Проектом Всемирного Банка «Ирригация,2» предусматривается передача в долговременное пользование и управление внутрихозяйственных оросительных и коллекторно-дренажных систем ассоциациям водопользователей как некоммерческим организациям. 
Согласно закону Азербайджанской Республики об изменениях и дополнениях (2004г.) в законе «О мелиорации и ирригации» предусматривается укрепление юридических основ АВП и переименование их в Объединения водопользователей (ОВП). В ОАО Мелиорации и водного хозяйства и на местах созданы соответственно Центральная и локальные группы поддержки ОВП.